MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid APP7_C

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010940	TTA	2	6	1764	1769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151402
2	NC_010940	TTGC	2	8	1789	1796	0 %	50 %	25 %	25 %	190151402
3	NC_010940	TTG	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151402
4	NC_010940	CT	3	6	1844	1849	0 %	50 %	0 %	50 %	190151402
5	NC_010940	AGT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151402
6	NC_010940	ATTT	2	8	1940	1947	25 %	75 %	0 %	0 %	190151402
7	NC_010940	T	6	6	1945	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
8	NC_010940	ATT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151402
9	NC_010940	GTTGA	2	10	2003	2012	20 %	40 %	40 %	0 %	190151402
10	NC_010940	C	6	6	2080	2085	0 %	0 %	0 %	100 %	190151402
11	NC_010940	TTC	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151402
12	NC_010940	T	6	6	2240	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
13	NC_010940	CTG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151402
14	NC_010940	CT	3	6	2363	2368	0 %	50 %	0 %	50 %	190151402
15	NC_010940	CTG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151402
16	NC_010940	TTGA	2	8	2463	2470	25 %	50 %	25 %	0 %	190151402
17	NC_010940	T	6	6	2475	2480	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
18	NC_010940	GTCG	2	8	2536	2543	0 %	25 %	50 %	25 %	190151402
19	NC_010940	CCGT	2	8	2577	2584	0 %	25 %	25 %	50 %	190151402
20	NC_010940	T	6	6	2603	2608	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
21	NC_010940	T	7	7	2640	2646	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
22	NC_010940	GTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151402
23	NC_010940	GTA	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151402
24	NC_010940	GCCT	2	8	2800	2807	0 %	25 %	25 %	50 %	190151402
25	NC_010940	GT	3	6	2814	2819	0 %	50 %	50 %	0 %	190151402
26	NC_010940	TTC	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151402
27	NC_010940	TTA	2	6	2955	2960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151402
28	NC_010940	GTC	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151402
29	NC_010940	ACT	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151402
30	NC_010940	A	6	6	3095	3100	100 %	0 %	0 %	0 %	190151402
31	NC_010940	T	6	6	3130	3135	0 %	100 %	0 %	0 %	190151403
32	NC_010940	T	7	7	3140	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	190151403
33	NC_010940	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	190151403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.